Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E1Q9Y466 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2E1Q9Y466 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2E1Q9Y466 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms