Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP3Q9Y446 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms