Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9Y3F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9Y3F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9Y3F1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q9Y3F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms