Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF11Q9Y3C5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF11Q9Y3C5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms