Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRELID3BQ9Y3B1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRELID3BQ9Y3B1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms