Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF3AQ9Y2N7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF3AQ9Y2N7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF3AQ9Y2N7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIF3AQ9Y2N7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF3AQ9Y2N7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF3AQ9Y2N7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIF3AQ9Y2N7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HIF3AQ9Y2N7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIF3AQ9Y2N7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms