Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC3Q9Y282 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC3Q9Y282 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms