Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNEQ9Y223 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNEQ9Y223 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GNEQ9Y223 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms