Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AGTPBP1Q9UPW5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AGTPBP1Q9UPW5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms