Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP1Q9UPQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms