Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX6Q9UPM6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX6Q9UPM6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms