Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPK3Q9UPE1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPK3Q9UPE1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK3Q9UPE1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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