Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTF2Q9UNY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTF2Q9UNY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms