Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDARQ9UNE0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EDARQ9UNE0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EDARQ9UNE0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms