Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNPO2Q9UMS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNPO2Q9UMS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNPO2Q9UMS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms