Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF490Q9ULM2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF490Q9ULM2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF490Q9ULM2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms