Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
ZNF608Q9ULD9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
ZNF608Q9ULD9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
ZNF608Q9ULD9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
ZNF608Q9ULD9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ZNF608Q9ULD9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
ZNF608Q9ULD9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms