Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI1Q9ULC6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI1Q9ULC6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms