Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAV3Q9UKW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms