Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO4Q9UKT5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms