Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3Q9UKS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms