Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN16Q9UKR8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN16Q9UKR8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms