Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPREB3Q9UKI3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPREB3Q9UKI3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms