Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf18Q9UK00 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms