Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSKSQ9UJT2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSKSQ9UJT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSKSQ9UJT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSKSQ9UJT2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms