Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK1NQ9UHG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCSK1NQ9UHG2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK1NQ9UHG2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms