Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA6Q9UF33 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms