Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXF1Q9UBU9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXF1Q9UBU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms