Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RRBP1Q9P2E9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RRBP1Q9P2E9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRBP1Q9P2E9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms