Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCHIP1Q9P0W5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCHIP1Q9P0W5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.7 ms