Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM9Q9P0T7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM9Q9P0T7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms