Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCMF1Q9P0J7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCMF1Q9P0J7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms