Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD4Q9NZQ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD4Q9NZQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD4Q9NZQ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms