Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
BICRAQ9NZM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC44.62■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
BICRAQ9NZM4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC44.54■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC44.52■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.72
BICRAQ9NZM4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
BICRAQ9NZM4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC44.42■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
BICRAQ9NZM4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms