Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC10Q9NYD6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC10Q9NYD6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC10Q9NYD6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms