Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC5A4Q9NY91 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC5A4Q9NY91 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A4Q9NY91 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A4Q9NY91 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms