Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BARHL2Q9NY43 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BARHL2Q9NY43 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARHL2Q9NY43 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms