Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR3EQ9NVU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms