Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATAD3AQ9NVI7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms