Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD2Q9NV79 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMTD2Q9NV79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms