Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD18Q9NS91 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD18Q9NS91 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms