Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKN1Q9NS71 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GKN1Q9NS71 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKN1Q9NS71 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms