Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB6BQ9NRW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB6BQ9NRW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms