Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLR9Q9NR96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms