Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MYO5CQ9NQX4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MYO5CQ9NQX4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MYO5CQ9NQX4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
MYO5CQ9NQX4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms