Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB3Q9NQW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGB3Q9NQW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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