Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEPEQ9NQ76 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms