Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FZD3Q9NPG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FZD3Q9NPG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms