Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC10

OTOF, Otoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOFQ9HC10 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OTOFQ9HC10 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOFQ9HC10 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.55■■■□□ 2
OTOFQ9HC10 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms