Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARVBQ9HBI1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms